Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ9

Prdm9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm9Q96EQ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prdm9Q96EQ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm9Q96EQ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prdm9Q96EQ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prdm9Q96EQ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm9Q96EQ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm9Q96EQ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm9Q96EQ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm9Q96EQ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm9Q96EQ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm9Q96EQ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm9Q96EQ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm9Q96EQ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm9Q96EQ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm9Q96EQ9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm9Q96EQ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm9Q96EQ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm9Q96EQ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm9Q96EQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm9Q96EQ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm9Q96EQ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm9Q96EQ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm9Q96EQ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm9Q96EQ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm9Q96EQ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm9Q96EQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm9Q96EQ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm9Q96EQ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm9Q96EQ9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm9Q96EQ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm9Q96EQ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm9Q96EQ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm9Q96EQ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm9Q96EQ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm9Q96EQ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm9Q96EQ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm9Q96EQ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm9Q96EQ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm9Q96EQ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms