Protein–RNA interactions for Protein: Q921U8

Smtn, Smoothelin, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmtnQ921U8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SmtnQ921U8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SmtnQ921U8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SmtnQ921U8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SmtnQ921U8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SmtnQ921U8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SmtnQ921U8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SmtnQ921U8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SmtnQ921U8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SmtnQ921U8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SmtnQ921U8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SmtnQ921U8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SmtnQ921U8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SmtnQ921U8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SmtnQ921U8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmtnQ921U8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SmtnQ921U8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SmtnQ921U8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SmtnQ921U8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SmtnQ921U8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SmtnQ921U8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SmtnQ921U8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SmtnQ921U8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SmtnQ921U8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SmtnQ921U8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SmtnQ921U8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms