Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ7

Pcdhb3, Protocadherin beta 3, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb3Q91XZ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdhb3Q91XZ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb3Q91XZ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb3Q91XZ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb3Q91XZ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb3Q91XZ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb3Q91XZ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb3Q91XZ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb3Q91XZ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb3Q91XZ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb3Q91XZ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb3Q91XZ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb3Q91XZ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcdhb3Q91XZ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb3Q91XZ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb3Q91XZ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb3Q91XZ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb3Q91XZ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb3Q91XZ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb3Q91XZ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb3Q91XZ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb3Q91XZ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb3Q91XZ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb3Q91XZ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb3Q91XZ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb3Q91XZ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb3Q91XZ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb3Q91XZ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb3Q91XZ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb3Q91XZ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms