Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usb1Q91W78 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usb1Q91W78 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usb1Q91W78 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usb1Q91W78 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usb1Q91W78 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usb1Q91W78 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usb1Q91W78 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms