Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps4aQ8VEJ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps4aQ8VEJ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps4aQ8VEJ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps4aQ8VEJ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps4aQ8VEJ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms