Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc115Q8VE99 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc115Q8VE99 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc115Q8VE99 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc115Q8VE99 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc115Q8VE99 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc115Q8VE99 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms