Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc80Q8R2G6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc80Q8R2G6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc80Q8R2G6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc80Q8R2G6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc80Q8R2G6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc80Q8R2G6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc80Q8R2G6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc80Q8R2G6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc80Q8R2G6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc80Q8R2G6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc80Q8R2G6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc80Q8R2G6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms