Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3H0

Appl1, DCC-interacting protein 13-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Appl1Q8K3H0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Appl1Q8K3H0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Appl1Q8K3H0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Appl1Q8K3H0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Appl1Q8K3H0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Appl1Q8K3H0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Appl1Q8K3H0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Appl1Q8K3H0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Appl1Q8K3H0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Appl1Q8K3H0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Appl1Q8K3H0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Appl1Q8K3H0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Appl1Q8K3H0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Appl1Q8K3H0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Appl1Q8K3H0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Appl1Q8K3H0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Appl1Q8K3H0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Appl1Q8K3H0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Appl1Q8K3H0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Appl1Q8K3H0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Appl1Q8K3H0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Appl1Q8K3H0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Appl1Q8K3H0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Appl1Q8K3H0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Appl1Q8K3H0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Appl1Q8K3H0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Appl1Q8K3H0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Appl1Q8K3H0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Appl1Q8K3H0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Appl1Q8K3H0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Appl1Q8K3H0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Appl1Q8K3H0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Appl1Q8K3H0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Appl1Q8K3H0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Appl1Q8K3H0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Appl1Q8K3H0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Appl1Q8K3H0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Appl1Q8K3H0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Appl1Q8K3H0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Appl1Q8K3H0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Appl1Q8K3H0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Appl1Q8K3H0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Appl1Q8K3H0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Appl1Q8K3H0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms