Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Txndc11Q8K2W3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Txndc11Q8K2W3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms