Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Txndc11Q8K2W3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Txndc11Q8K2W3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Txndc11Q8K2W3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Txndc11Q8K2W3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Txndc11Q8K2W3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Txndc11Q8K2W3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Txndc11Q8K2W3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Txndc11Q8K2W3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Txndc11Q8K2W3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Txndc11Q8K2W3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Txndc11Q8K2W3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms