Protein–RNA interactions for Protein: Q8K071

Tmem221, Transmembrane protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem221Q8K071 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem221Q8K071 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem221Q8K071 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem221Q8K071 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem221Q8K071 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem221Q8K071 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem221Q8K071 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem221Q8K071 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem221Q8K071 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms