Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TwnkQ8CIW5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TwnkQ8CIW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TwnkQ8CIW5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TwnkQ8CIW5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TwnkQ8CIW5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TwnkQ8CIW5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TwnkQ8CIW5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TwnkQ8CIW5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TwnkQ8CIW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TwnkQ8CIW5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TwnkQ8CIW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TwnkQ8CIW5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms