Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG64

Fkrp, Fukutin-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FkrpQ8CG64 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FkrpQ8CG64 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FkrpQ8CG64 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FkrpQ8CG64 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FkrpQ8CG64 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FkrpQ8CG64 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FkrpQ8CG64 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FkrpQ8CG64 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FkrpQ8CG64 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FkrpQ8CG64 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FkrpQ8CG64 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FkrpQ8CG64 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FkrpQ8CG64 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FkrpQ8CG64 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FkrpQ8CG64 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FkrpQ8CG64 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FkrpQ8CG64 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms