Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm9955Q8CEJ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm9955Q8CEJ8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm9955Q8CEJ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm9955Q8CEJ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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