Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCK0

H2afy2, Core histone macro-H2A.2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afy2Q8CCK0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2afy2Q8CCK0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H2afy2Q8CCK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2afy2Q8CCK0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afy2Q8CCK0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afy2Q8CCK0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afy2Q8CCK0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afy2Q8CCK0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms