Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rassf4Q8CB96 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rassf4Q8CB96 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rassf4Q8CB96 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rassf4Q8CB96 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rassf4Q8CB96 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rassf4Q8CB96 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rassf4Q8CB96 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rassf4Q8CB96 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rassf4Q8CB96 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rassf4Q8CB96 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rassf4Q8CB96 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rassf4Q8CB96 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rassf4Q8CB96 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rassf4Q8CB96 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rassf4Q8CB96 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rassf4Q8CB96 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rassf4Q8CB96 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rassf4Q8CB96 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rassf4Q8CB96 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rassf4Q8CB96 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms