Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc186Q8C9S4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc186Q8C9S4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc186Q8C9S4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc186Q8C9S4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc186Q8C9S4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc186Q8C9S4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc186Q8C9S4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc186Q8C9S4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc186Q8C9S4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc186Q8C9S4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc186Q8C9S4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc186Q8C9S4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc186Q8C9S4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc186Q8C9S4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc186Q8C9S4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc186Q8C9S4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc186Q8C9S4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc186Q8C9S4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc186Q8C9S4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc186Q8C9S4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc186Q8C9S4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc186Q8C9S4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc186Q8C9S4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc186Q8C9S4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc186Q8C9S4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc186Q8C9S4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc186Q8C9S4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms