Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vwc2Q8C8N3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vwc2Q8C8N3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vwc2Q8C8N3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vwc2Q8C8N3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vwc2Q8C8N3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vwc2Q8C8N3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vwc2Q8C8N3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Vwc2Q8C8N3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vwc2Q8C8N3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vwc2Q8C8N3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vwc2Q8C8N3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vwc2Q8C8N3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vwc2Q8C8N3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vwc2Q8C8N3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vwc2Q8C8N3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vwc2Q8C8N3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vwc2Q8C8N3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwc2Q8C8N3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vwc2Q8C8N3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwc2Q8C8N3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwc2Q8C8N3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vwc2Q8C8N3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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