Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Apol7cQ8C6E1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Apol7cQ8C6E1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Apol7cQ8C6E1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Apol7cQ8C6E1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Apol7cQ8C6E1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Apol7cQ8C6E1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Apol7cQ8C6E1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Apol7cQ8C6E1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Apol7cQ8C6E1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Apol7cQ8C6E1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Apol7cQ8C6E1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Apol7cQ8C6E1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Apol7cQ8C6E1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Apol7cQ8C6E1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Apol7cQ8C6E1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Apol7cQ8C6E1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Apol7cQ8C6E1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Apol7cQ8C6E1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Apol7cQ8C6E1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Apol7cQ8C6E1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Apol7cQ8C6E1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Apol7cQ8C6E1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Apol7cQ8C6E1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apol7cQ8C6E1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Apol7cQ8C6E1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Apol7cQ8C6E1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Apol7cQ8C6E1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Apol7cQ8C6E1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Apol7cQ8C6E1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Apol7cQ8C6E1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Apol7cQ8C6E1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Apol7cQ8C6E1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Apol7cQ8C6E1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Apol7cQ8C6E1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Apol7cQ8C6E1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Apol7cQ8C6E1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Apol7cQ8C6E1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47,5 ms