Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ssuh2Q8C3L1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssuh2Q8C3L1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ssuh2Q8C3L1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ssuh2Q8C3L1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ssuh2Q8C3L1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssuh2Q8C3L1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssuh2Q8C3L1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ssuh2Q8C3L1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ssuh2Q8C3L1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssuh2Q8C3L1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssuh2Q8C3L1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssuh2Q8C3L1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssuh2Q8C3L1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssuh2Q8C3L1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssuh2Q8C3L1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms