Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Camsap2Q8C1B1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Camsap2Q8C1B1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Camsap2Q8C1B1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Camsap2Q8C1B1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Camsap2Q8C1B1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Camsap2Q8C1B1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Camsap2Q8C1B1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Camsap2Q8C1B1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Camsap2Q8C1B1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Camsap2Q8C1B1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Camsap2Q8C1B1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Camsap2Q8C1B1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Camsap2Q8C1B1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Camsap2Q8C1B1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Camsap2Q8C1B1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Camsap2Q8C1B1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Camsap2Q8C1B1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Camsap2Q8C1B1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Camsap2Q8C1B1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Camsap2Q8C1B1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Camsap2Q8C1B1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Camsap2Q8C1B1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Camsap2Q8C1B1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Camsap2Q8C1B1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Camsap2Q8C1B1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Camsap2Q8C1B1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Camsap2Q8C1B1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Camsap2Q8C1B1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Camsap2Q8C1B1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Camsap2Q8C1B1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Camsap2Q8C1B1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Camsap2Q8C1B1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Camsap2Q8C1B1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Camsap2Q8C1B1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Camsap2Q8C1B1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Camsap2Q8C1B1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Camsap2Q8C1B1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Camsap2Q8C1B1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Camsap2Q8C1B1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Camsap2Q8C1B1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Camsap2Q8C1B1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Camsap2Q8C1B1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Camsap2Q8C1B1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Camsap2Q8C1B1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Camsap2Q8C1B1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Camsap2Q8C1B1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Camsap2Q8C1B1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Camsap2Q8C1B1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Camsap2Q8C1B1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Camsap2Q8C1B1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Camsap2Q8C1B1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Camsap2Q8C1B1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Camsap2Q8C1B1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Camsap2Q8C1B1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Camsap2Q8C1B1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Camsap2Q8C1B1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Camsap2Q8C1B1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Camsap2Q8C1B1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Camsap2Q8C1B1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Camsap2Q8C1B1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Camsap2Q8C1B1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Camsap2Q8C1B1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Camsap2Q8C1B1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Camsap2Q8C1B1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Camsap2Q8C1B1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Camsap2Q8C1B1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Camsap2Q8C1B1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Camsap2Q8C1B1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Camsap2Q8C1B1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Camsap2Q8C1B1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Camsap2Q8C1B1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Camsap2Q8C1B1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Camsap2Q8C1B1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Camsap2Q8C1B1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Camsap2Q8C1B1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Camsap2Q8C1B1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Camsap2Q8C1B1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Camsap2Q8C1B1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Camsap2Q8C1B1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Camsap2Q8C1B1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Camsap2Q8C1B1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Camsap2Q8C1B1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Camsap2Q8C1B1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Camsap2Q8C1B1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Camsap2Q8C1B1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Camsap2Q8C1B1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Camsap2Q8C1B1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Camsap2Q8C1B1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Camsap2Q8C1B1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Camsap2Q8C1B1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Camsap2Q8C1B1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Camsap2Q8C1B1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Camsap2Q8C1B1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Camsap2Q8C1B1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Camsap2Q8C1B1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Camsap2Q8C1B1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Camsap2Q8C1B1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Camsap2Q8C1B1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Camsap2Q8C1B1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms