Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arfrp1Q8BXL7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arfrp1Q8BXL7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arfrp1Q8BXL7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfrp1Q8BXL7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arfrp1Q8BXL7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfrp1Q8BXL7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms