Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trerf1Q8BXJ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trerf1Q8BXJ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Trerf1Q8BXJ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Trerf1Q8BXJ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Trerf1Q8BXJ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Trerf1Q8BXJ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Trerf1Q8BXJ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Trerf1Q8BXJ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trerf1Q8BXJ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,9 ms