Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Catsper4Q8BVN3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Catsper4Q8BVN3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Catsper4Q8BVN3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Catsper4Q8BVN3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Catsper4Q8BVN3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Catsper4Q8BVN3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsper4Q8BVN3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms