Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lmod1Q8BVA4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmod1Q8BVA4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Lmod1Q8BVA4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lmod1Q8BVA4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Lmod1Q8BVA4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lmod1Q8BVA4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lmod1Q8BVA4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lmod1Q8BVA4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lmod1Q8BVA4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lmod1Q8BVA4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod1Q8BVA4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmod1Q8BVA4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod1Q8BVA4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lmod1Q8BVA4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmod1Q8BVA4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmod1Q8BVA4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lmod1Q8BVA4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lmod1Q8BVA4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod1Q8BVA4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod1Q8BVA4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod1Q8BVA4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmod1Q8BVA4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lmod1Q8BVA4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmod1Q8BVA4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmod1Q8BVA4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmod1Q8BVA4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lmod1Q8BVA4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lmod1Q8BVA4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Lmod1Q8BVA4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lmod1Q8BVA4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lmod1Q8BVA4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lmod1Q8BVA4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lmod1Q8BVA4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lmod1Q8BVA4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmod1Q8BVA4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmod1Q8BVA4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmod1Q8BVA4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmod1Q8BVA4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmod1Q8BVA4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmod1Q8BVA4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmod1Q8BVA4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmod1Q8BVA4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmod1Q8BVA4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lmod1Q8BVA4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmod1Q8BVA4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms