Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM3

Ptpn7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn7Q8BUM3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn7Q8BUM3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn7Q8BUM3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn7Q8BUM3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn7Q8BUM3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn7Q8BUM3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn7Q8BUM3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn7Q8BUM3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn7Q8BUM3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn7Q8BUM3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptpn7Q8BUM3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ptpn7Q8BUM3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpn7Q8BUM3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn7Q8BUM3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms