Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrp12Q8BUJ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrp12Q8BUJ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp12Q8BUJ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp12Q8BUJ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp12Q8BUJ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrp12Q8BUJ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrp12Q8BUJ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp12Q8BUJ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrp12Q8BUJ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp12Q8BUJ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrp12Q8BUJ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrp12Q8BUJ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrp12Q8BUJ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrp12Q8BUJ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrp12Q8BUJ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrp12Q8BUJ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrp12Q8BUJ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrp12Q8BUJ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp12Q8BUJ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp12Q8BUJ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrp12Q8BUJ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp12Q8BUJ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms