Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PcgF3Q8BTQ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PcgF3Q8BTQ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PcgF3Q8BTQ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PcgF3Q8BTQ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PcgF3Q8BTQ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PcgF3Q8BTQ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PcgF3Q8BTQ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PcgF3Q8BTQ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PcgF3Q8BTQ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PcgF3Q8BTQ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PcgF3Q8BTQ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcgF3Q8BTQ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms