Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf3c2Q8BL74 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtf3c2Q8BL74 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gtf3c2Q8BL74 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gtf3c2Q8BL74 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf3c2Q8BL74 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf3c2Q8BL74 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf3c2Q8BL74 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf3c2Q8BL74 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf3c2Q8BL74 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtf3c2Q8BL74 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf3c2Q8BL74 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf3c2Q8BL74 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c2Q8BL74 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c2Q8BL74 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c2Q8BL74 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c2Q8BL74 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c2Q8BL74 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms