Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH04

Pck2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pck2Q8BH04 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pck2Q8BH04 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pck2Q8BH04 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pck2Q8BH04 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pck2Q8BH04 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pck2Q8BH04 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pck2Q8BH04 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pck2Q8BH04 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pck2Q8BH04 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pck2Q8BH04 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pck2Q8BH04 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pck2Q8BH04 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pck2Q8BH04 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pck2Q8BH04 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms