Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG16

Slc6a15, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT2, mousemouse

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a15Q8BG16 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a15Q8BG16 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a15Q8BG16 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a15Q8BG16 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a15Q8BG16 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a15Q8BG16 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a15Q8BG16 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms