Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Liat1Q810M6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Liat1Q810M6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Liat1Q810M6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Liat1Q810M6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Liat1Q810M6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Liat1Q810M6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Liat1Q810M6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Liat1Q810M6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Liat1Q810M6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Liat1Q810M6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Liat1Q810M6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Liat1Q810M6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Liat1Q810M6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Liat1Q810M6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Liat1Q810M6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Liat1Q810M6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Liat1Q810M6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Liat1Q810M6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Liat1Q810M6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Liat1Q810M6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Liat1Q810M6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Liat1Q810M6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Liat1Q810M6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Liat1Q810M6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Liat1Q810M6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Liat1Q810M6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Liat1Q810M6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Liat1Q810M6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Liat1Q810M6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Liat1Q810M6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Liat1Q810M6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Liat1Q810M6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Liat1Q810M6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Liat1Q810M6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Liat1Q810M6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Liat1Q810M6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Liat1Q810M6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Liat1Q810M6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Liat1Q810M6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Liat1Q810M6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Liat1Q810M6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Liat1Q810M6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Liat1Q810M6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Liat1Q810M6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Liat1Q810M6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Liat1Q810M6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Liat1Q810M6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Liat1Q810M6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Liat1Q810M6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Liat1Q810M6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Liat1Q810M6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Liat1Q810M6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Liat1Q810M6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Liat1Q810M6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Liat1Q810M6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Liat1Q810M6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Liat1Q810M6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Liat1Q810M6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Liat1Q810M6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Liat1Q810M6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Liat1Q810M6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Liat1Q810M6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Liat1Q810M6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Liat1Q810M6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Liat1Q810M6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Liat1Q810M6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Liat1Q810M6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Liat1Q810M6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Liat1Q810M6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Liat1Q810M6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Liat1Q810M6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Liat1Q810M6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Liat1Q810M6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Liat1Q810M6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Liat1Q810M6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Liat1Q810M6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Liat1Q810M6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Liat1Q810M6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Liat1Q810M6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Liat1Q810M6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Liat1Q810M6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Liat1Q810M6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Liat1Q810M6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Liat1Q810M6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Liat1Q810M6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Liat1Q810M6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms