Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,92■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,91■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
RbsnQ80Y56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
RbsnQ80Y56 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,87■■□□□ 1,73
RbsnQ80Y56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
RbsnQ80Y56 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
RbsnQ80Y56 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
RbsnQ80Y56 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
RbsnQ80Y56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
RbsnQ80Y56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
RbsnQ80Y56 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
RbsnQ80Y56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
RbsnQ80Y56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,79■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
RbsnQ80Y56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,76■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,75■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
RbsnQ80Y56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
RbsnQ80Y56 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25,62■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
RbsnQ80Y56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
RbsnQ80Y56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25,5■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
RbsnQ80Y56 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,4 ms