Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcsk9Q80W65 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcsk9Q80W65 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcsk9Q80W65 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcsk9Q80W65 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcsk9Q80W65 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcsk9Q80W65 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcsk9Q80W65 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk9Q80W65 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk9Q80W65 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk9Q80W65 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk9Q80W65 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcsk9Q80W65 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcsk9Q80W65 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcsk9Q80W65 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcsk9Q80W65 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk9Q80W65 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcsk9Q80W65 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcsk9Q80W65 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pcsk9Q80W65 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcsk9Q80W65 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcsk9Q80W65 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcsk9Q80W65 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcsk9Q80W65 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcsk9Q80W65 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcsk9Q80W65 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcsk9Q80W65 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcsk9Q80W65 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcsk9Q80W65 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcsk9Q80W65 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcsk9Q80W65 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcsk9Q80W65 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcsk9Q80W65 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcsk9Q80W65 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcsk9Q80W65 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcsk9Q80W65 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pcsk9Q80W65 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pcsk9Q80W65 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
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