Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Otop3Q80UF9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Otop3Q80UF9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Otop3Q80UF9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Otop3Q80UF9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Otop3Q80UF9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Otop3Q80UF9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Otop3Q80UF9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Otop3Q80UF9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Otop3Q80UF9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Otop3Q80UF9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Otop3Q80UF9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Otop3Q80UF9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Otop3Q80UF9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Otop3Q80UF9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Otop3Q80UF9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Otop3Q80UF9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Otop3Q80UF9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Otop3Q80UF9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Otop3Q80UF9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Otop3Q80UF9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Otop3Q80UF9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Otop3Q80UF9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Otop3Q80UF9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Otop3Q80UF9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Otop3Q80UF9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Otop3Q80UF9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Otop3Q80UF9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Otop3Q80UF9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Otop3Q80UF9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Otop3Q80UF9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Otop3Q80UF9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Otop3Q80UF9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Otop3Q80UF9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Otop3Q80UF9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Otop3Q80UF9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Otop3Q80UF9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Otop3Q80UF9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Otop3Q80UF9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Otop3Q80UF9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Otop3Q80UF9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Otop3Q80UF9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Otop3Q80UF9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Otop3Q80UF9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Otop3Q80UF9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Otop3Q80UF9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Otop3Q80UF9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Otop3Q80UF9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Otop3Q80UF9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Otop3Q80UF9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Otop3Q80UF9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Otop3Q80UF9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Otop3Q80UF9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Otop3Q80UF9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms