Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp3Q7TST5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamp3Q7TST5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamp3Q7TST5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamp3Q7TST5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lamp3Q7TST5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp3Q7TST5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lamp3Q7TST5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamp3Q7TST5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms