Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ctdp1Q7TSG2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ctdp1Q7TSG2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ctdp1Q7TSG2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ctdp1Q7TSG2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ctdp1Q7TSG2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ctdp1Q7TSG2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Ctdp1Q7TSG2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ctdp1Q7TSG2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26,45■■□□□ 1,83
Ctdp1Q7TSG2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
Ctdp1Q7TSG2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ctdp1Q7TSG2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ctdp1Q7TSG2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Ctdp1Q7TSG2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ctdp1Q7TSG2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ctdp1Q7TSG2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ctdp1Q7TSG2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Ctdp1Q7TSG2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Ctdp1Q7TSG2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26,36■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ctdp1Q7TSG2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ctdp1Q7TSG2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms