Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dsg4Q7TMD7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dsg4Q7TMD7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dsg4Q7TMD7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dsg4Q7TMD7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dsg4Q7TMD7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg4Q7TMD7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg4Q7TMD7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg4Q7TMD7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg4Q7TMD7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg4Q7TMD7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg4Q7TMD7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg4Q7TMD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dsg4Q7TMD7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dsg4Q7TMD7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dsg4Q7TMD7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dsg4Q7TMD7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dsg4Q7TMD7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dsg4Q7TMD7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dsg4Q7TMD7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms