Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Atp1a3Q6PIC6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Atp1a3Q6PIC6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Atp1a3Q6PIC6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Atp1a3Q6PIC6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Atp1a3Q6PIC6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Atp1a3Q6PIC6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Atp1a3Q6PIC6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Atp1a3Q6PIC6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Atp1a3Q6PIC6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Atp1a3Q6PIC6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Atp1a3Q6PIC6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Atp1a3Q6PIC6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Atp1a3Q6PIC6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Atp1a3Q6PIC6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Atp1a3Q6PIC6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Atp1a3Q6PIC6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Atp1a3Q6PIC6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Atp1a3Q6PIC6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Atp1a3Q6PIC6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Atp1a3Q6PIC6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Atp1a3Q6PIC6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Atp1a3Q6PIC6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Atp1a3Q6PIC6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Atp1a3Q6PIC6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Atp1a3Q6PIC6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Atp1a3Q6PIC6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Atp1a3Q6PIC6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Atp1a3Q6PIC6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Atp1a3Q6PIC6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Atp1a3Q6PIC6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Atp1a3Q6PIC6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Atp1a3Q6PIC6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Atp1a3Q6PIC6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Atp1a3Q6PIC6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Atp1a3Q6PIC6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Atp1a3Q6PIC6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Atp1a3Q6PIC6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Atp1a3Q6PIC6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Atp1a3Q6PIC6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Atp1a3Q6PIC6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Atp1a3Q6PIC6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Atp1a3Q6PIC6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Atp1a3Q6PIC6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,6 ms