Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SvoplQ6PDF3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SvoplQ6PDF3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SvoplQ6PDF3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SvoplQ6PDF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SvoplQ6PDF3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SvoplQ6PDF3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SvoplQ6PDF3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SvoplQ6PDF3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SvoplQ6PDF3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms