Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Atl2Q6PA06 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atl2Q6PA06 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atl2Q6PA06 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atl2Q6PA06 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atl2Q6PA06 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atl2Q6PA06 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl2Q6PA06 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atl2Q6PA06 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atl2Q6PA06 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Atl2Q6PA06 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atl2Q6PA06 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atl2Q6PA06 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atl2Q6PA06 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl2Q6PA06 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl2Q6PA06 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atl2Q6PA06 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atl2Q6PA06 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atl2Q6PA06 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atl2Q6PA06 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atl2Q6PA06 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atl2Q6PA06 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl2Q6PA06 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl2Q6PA06 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atl2Q6PA06 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl2Q6PA06 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl2Q6PA06 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atl2Q6PA06 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl2Q6PA06 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl2Q6PA06 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl2Q6PA06 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl2Q6PA06 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atl2Q6PA06 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atl2Q6PA06 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atl2Q6PA06 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atl2Q6PA06 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atl2Q6PA06 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atl2Q6PA06 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atl2Q6PA06 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atl2Q6PA06 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms