Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd3Q6P9Z1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd3Q6P9Z1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd3Q6P9Z1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd3Q6P9Z1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcd3Q6P9Z1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcd3Q6P9Z1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcd3Q6P9Z1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcd3Q6P9Z1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcd3Q6P9Z1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcd3Q6P9Z1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcd3Q6P9Z1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcd3Q6P9Z1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcd3Q6P9Z1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd3Q6P9Z1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd3Q6P9Z1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd3Q6P9Z1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd3Q6P9Z1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd3Q6P9Z1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd3Q6P9Z1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd3Q6P9Z1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd3Q6P9Z1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd3Q6P9Z1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd3Q6P9Z1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd3Q6P9Z1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcd3Q6P9Z1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms