Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gga2Q6P5E6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gga2Q6P5E6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gga2Q6P5E6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gga2Q6P5E6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gga2Q6P5E6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gga2Q6P5E6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga2Q6P5E6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga2Q6P5E6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gga2Q6P5E6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga2Q6P5E6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga2Q6P5E6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gga2Q6P5E6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gga2Q6P5E6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gga2Q6P5E6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gga2Q6P5E6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gga2Q6P5E6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gga2Q6P5E6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gga2Q6P5E6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga2Q6P5E6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga2Q6P5E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gga2Q6P5E6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gga2Q6P5E6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga2Q6P5E6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga2Q6P5E6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga2Q6P5E6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gga2Q6P5E6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gga2Q6P5E6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms