Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1I6

Psd2, PH and SEC7 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd2Q6P1I6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psd2Q6P1I6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psd2Q6P1I6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd2Q6P1I6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd2Q6P1I6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psd2Q6P1I6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Psd2Q6P1I6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psd2Q6P1I6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psd2Q6P1I6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psd2Q6P1I6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psd2Q6P1I6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psd2Q6P1I6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psd2Q6P1I6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psd2Q6P1I6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psd2Q6P1I6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Psd2Q6P1I6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psd2Q6P1I6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psd2Q6P1I6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psd2Q6P1I6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Psd2Q6P1I6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Psd2Q6P1I6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psd2Q6P1I6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psd2Q6P1I6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psd2Q6P1I6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psd2Q6P1I6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psd2Q6P1I6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psd2Q6P1I6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psd2Q6P1I6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd2Q6P1I6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psd2Q6P1I6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psd2Q6P1I6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms