Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm2bQ6P1G2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Kdm2bQ6P1G2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Kdm2bQ6P1G2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm2bQ6P1G2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm2bQ6P1G2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm2bQ6P1G2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm2bQ6P1G2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm2bQ6P1G2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm2bQ6P1G2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kdm2bQ6P1G2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm2bQ6P1G2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm2bQ6P1G2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm2bQ6P1G2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm2bQ6P1G2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm2bQ6P1G2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm2bQ6P1G2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm2bQ6P1G2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm2bQ6P1G2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm2bQ6P1G2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Kdm2bQ6P1G2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm2bQ6P1G2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm2bQ6P1G2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm2bQ6P1G2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm2bQ6P1G2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm2bQ6P1G2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm2bQ6P1G2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm2bQ6P1G2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm2bQ6P1G2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm2bQ6P1G2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm2bQ6P1G2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm2bQ6P1G2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm2bQ6P1G2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm2bQ6P1G2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm2bQ6P1G2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm2bQ6P1G2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm2bQ6P1G2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdm2bQ6P1G2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm2bQ6P1G2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm2bQ6P1G2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm2bQ6P1G2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm2bQ6P1G2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Kdm2bQ6P1G2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Kdm2bQ6P1G2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm2bQ6P1G2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Kdm2bQ6P1G2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Kdm2bQ6P1G2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Kdm2bQ6P1G2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Kdm2bQ6P1G2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Kdm2bQ6P1G2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Kdm2bQ6P1G2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2bQ6P1G2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm2bQ6P1G2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2bQ6P1G2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2bQ6P1G2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm2bQ6P1G2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm2bQ6P1G2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Kdm2bQ6P1G2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms