Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Krt39Q6IFX4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Krt39Q6IFX4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krt39Q6IFX4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krt39Q6IFX4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krt39Q6IFX4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt39Q6IFX4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt39Q6IFX4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt39Q6IFX4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krt39Q6IFX4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt39Q6IFX4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt39Q6IFX4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt39Q6IFX4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt39Q6IFX4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt39Q6IFX4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt39Q6IFX4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krt39Q6IFX4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krt39Q6IFX4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt39Q6IFX4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Krt39Q6IFX4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt39Q6IFX4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt39Q6IFX4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt39Q6IFX4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt39Q6IFX4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt39Q6IFX4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt39Q6IFX4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt39Q6IFX4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Krt39Q6IFX4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt39Q6IFX4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt39Q6IFX4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms