Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ablim3Q69ZX8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ablim3Q69ZX8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ablim3Q69ZX8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ablim3Q69ZX8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ablim3Q69ZX8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ablim3Q69ZX8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ablim3Q69ZX8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ablim3Q69ZX8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ablim3Q69ZX8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ablim3Q69ZX8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ablim3Q69ZX8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ablim3Q69ZX8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ablim3Q69ZX8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ablim3Q69ZX8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ablim3Q69ZX8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ablim3Q69ZX8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ablim3Q69ZX8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ablim3Q69ZX8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ablim3Q69ZX8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ablim3Q69ZX8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ablim3Q69ZX8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ablim3Q69ZX8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ablim3Q69ZX8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ablim3Q69ZX8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ablim3Q69ZX8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ablim3Q69ZX8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ablim3Q69ZX8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ablim3Q69ZX8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ablim3Q69ZX8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ablim3Q69ZX8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ablim3Q69ZX8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ablim3Q69ZX8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ablim3Q69ZX8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms