Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc8eQ66JT1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc8eQ66JT1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc8eQ66JT1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc8eQ66JT1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc8eQ66JT1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc8eQ66JT1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc8eQ66JT1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms