Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn13Q64512 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn13Q64512 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn13Q64512 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn13Q64512 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn13Q64512 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn13Q64512 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn13Q64512 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms