Protein–RNA interactions for Protein: Q63739

Ptp4a1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a1Q63739 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptp4a1Q63739 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ptp4a1Q63739 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptp4a1Q63739 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptp4a1Q63739 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptp4a1Q63739 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptp4a1Q63739 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptp4a1Q63739 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptp4a1Q63739 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptp4a1Q63739 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptp4a1Q63739 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptp4a1Q63739 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptp4a1Q63739 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ptp4a1Q63739 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptp4a1Q63739 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptp4a1Q63739 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a1Q63739 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptp4a1Q63739 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptp4a1Q63739 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a1Q63739 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a1Q63739 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a1Q63739 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a1Q63739 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptp4a1Q63739 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptp4a1Q63739 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms