Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sprr1bQ62267 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sprr1bQ62267 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sprr1bQ62267 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sprr1bQ62267 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sprr1bQ62267 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sprr1bQ62267 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.7 ms